RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 DSEQ9UL01 958 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 A0A1B0GTH6 734 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NRBF2Q96F24 287 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 H0Y626 953 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 THP07101 528 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 HOXC6P09630 235 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 TMC7Q7Z402 723 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 AP1G2O75843 785 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PAK5Q9P286 719 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SLC9A1P19634 815 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 DSG3P32926 999 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 AMPD2Q01433 879 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NCAPHQ15003 741 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 GYG2O15488 501 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SERPIND1P05546 499 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 EPHB2P29323 1055 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ESYT3A0FGR9 886 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF263O14978 683 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 MAPRE2Q15555 327 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NAB2Q15742 525 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 CTXN3Q4LDR2 81 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SMAPO00193 183 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 F9P00740 461 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 AKR1A1P14550 325 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF280DQ6N043 979 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 USP49Q70CQ1 688 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 FBXO32Q969P5 355 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 DDIT4Q9NX09 232 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 AMACRQ9UHK6 382 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ATP5HO75947 161 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 KITP10721 976 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 GRAMD1BQ3KR37 738 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 KIF2CQ99661 725 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PXMP2Q9NR77 195 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 IPPQ9Y573 584 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PLSCR1O15162 318 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 C4orf22Q6V702 233 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 FGFR2P21802 821 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NDE1Q9NXR1 346 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PKP3Q9Y446 797 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ALDH2P05091 517 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ARP10275 920 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 GARTP22102 1010 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 ARFIP2P53365 341 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 CUL2Q13617 745 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PCSK7Q16549 785 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 SPATA18Q8TC71 538 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRO-202ENST00000348962 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms