RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ALOX15BO15296 676 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 EXTL3O43909 919 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZBED4O75132 1171 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PTPN7P35236 360 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TAS2R40P59535 323 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NOMO3P69849 1222 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CLDN10P78369 228 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PSMD6Q15008 389 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 UGCGQ16739 394 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 IL31RAQ8NI17 732 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPDL1Q96EA4 605 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LRRC42Q9Y546 428 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PSME4Q14997 1843 aa14.63□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GNAZP19086 355 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CD58P19256 250 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GCAP28676 217 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CAP2P40123 477 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PIK3CAP42336 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ARSEP51690 589 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C10orf82Q8WW14 230 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 HAO1Q9UJM8 370 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 USTQ9Y2C2 406 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C2CD2LO14523 706 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D12O60347 775 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 HLA-DRAP01903 254 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PTPN4P29074 926 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GNA15P30679 374 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TAP1Q03518 808 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GPS1Q13098 491 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPP2Q13103 211 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC142Q17RM4 750 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZACNQ401N2 412 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LONP2Q86WA8 852 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 COL20A1Q9P218 1284 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.62□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 KRT1P04264 644 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CALB1P05937 261 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ITGAVP06756 1048 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GJC1P36383 396 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CUL2Q13617 745 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 STYK1Q6J9G0 422 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CCDC125Q86Z20 511 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FAM13CQ8NE31 585 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TLE6Q9H808 572 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SMAPO00193 183 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NFIBO00712 420 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TM9SF1O15321 606 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TYROBPO43914 113 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PEX11AO75192 247 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TNNI1P19237 187 aa14.61□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 GCKP35557 465 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms