RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308208.9

CCDC63-201, Transcript of coiled-coil domain containing 63, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC63, Length 1,993 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63-201ENST00000308208 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 L1RE1Q9UN81 338 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 CD58P19256 250 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 CETN1Q12798 172 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 SV2CQ496J9 727 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 WDR44Q5JSH3 913 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 ASPAP45381 313 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 KRT17Q04695 432 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 Q7L0L9 218 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 SUSD3Q96L08 255 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 SIX2Q9NPC8 291 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 NME7Q9Y5B8 376 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PNPLA4P41247 253 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TNNC1P63316 161 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 GRIN2CQ14957 1233 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 CCDC142Q17RM4 750 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TRIM5Q9C035 493 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 P4HA2O15460 535 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 EFEMP2O95967 443 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 LMO2P25791 158 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PPM1AP35813 382 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TMC7Q7Z402 723 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 OSTM1Q86WC4 334 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 H3BNC9 293 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 M0QZQ0 153 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PMM2O15305 246 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 HUS1O60921 280 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 CALCAP01258 141 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PDGFRBP09619 1106 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 ATICP31939 592 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PLCB3Q01970 1234 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 ZNF394Q53GI3 561 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 KIAA1841Q6NSI8 718 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 APPL2Q8NEU8 664 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TMEM209Q96SK2 561 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TCF25Q9BQ70 676 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TSC2P49815 1807 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 LPXNO60711 386 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 NOL4O94818 638 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 SOD2P04179 222 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 NT5C1BQ96P26 610 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 TTPALQ9BTX7 342 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 PLVAPQ9BX97 442 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC63-201ENST00000308208 HIDE1A8MVS5 230 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 TRAPPC3O43617 180 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 OR4Q2P0C623 313 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 USP41Q3LFD5 358 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.83■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 ADAM12O43184 909 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 FGFR3P22607 806 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 ARPP19P56211 112 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 OR6B3Q8NGW1 331 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 CHST7Q9NS84 486 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC63-201ENST00000308208 ATP2C2O75185 946 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms