RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.97□□□□□ -1.45
PDCL2-201ENST00000295645 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
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PDCL2-201ENST00000295645 TOR1BO14657 336 aa5.96□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 SLC16A6O15403 523 aa5.96□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 GNAI3P08754 354 aa5.96□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 MALP21145 153 aa5.96□□□□□ -1.46
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PDCL2-201ENST00000295645 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.96□□□□□ -1.46
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PDCL2-201ENST00000295645 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.94□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.94□□□□□ -1.46
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PDCL2-201ENST00000295645 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PDCL2-201ENST00000295645 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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PDCL2-201ENST00000295645 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.92□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.92□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 PPP3CBP16298 524 aa5.91□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 PIK3CGP48736 1102 aa5.91□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 TCF15Q12870 199 aa5.91□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.91□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.91□□□□□ -1.46
PDCL2-201ENST00000295645 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.91□□□□□ -1.46
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