RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 PEX2P28328 305 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MLH1P40692 756 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SFT2D3Q587I9 215 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf63Q6NUN7 778 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARMCX6Q7L4S7 300 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF384Q8TF68 577 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C7orf43Q8WVR3 580 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HAS1Q92839 578 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC127Q96BQ5 260 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CEP95Q96GE4 821 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TTC25Q96NG3 672 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ACAP3Q96P50 834 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SH3GLB1Q9Y371 365 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 A8MXQ7 604 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC166P0CW27 439 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SSTR1P30872 391 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARSEP51690 589 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SLC25A3Q00325 362 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CAV1Q03135 178 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HIC1Q14526 733 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM259Q4ZIN3 620 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARSHQ5FYA8 562 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PYROXD1Q8WU10 500 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HOMER2Q9NSB8 354 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ALAS1P13196 640 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 VCLP18206 1134 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SH3D19Q5HYK7 790 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LLGL2Q6P1M3 1020 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 GALNT4Q8N4A0 578 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 BBOF1Q8ND07 529 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PANX3Q96QZ0 392 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LGALS13Q9UHV8 139 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 EMSYQ7Z589 1322 aa12□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LOC100653049A0A140TA62 436 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SGK1O00141 431 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KRT34O76011 436 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINB8P50452 374 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C12orf60Q5U649 245 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MORC4Q8TE76 937 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC19Q9H756 370 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 USP54Q70EL1 1684 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ASTN1O14525 1302 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 MAN1A1P33908 653 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 GRIA2P42262 883 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DYNLT1P63172 113 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PICALMQ13492 652 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB46Q86UZ6 589 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 DCLK3Q9C098 648 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LZTS1Q9Y250 596 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN8A6NHC0 703 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KRT10P13645 584 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PMLP29590 882 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CHN2P52757 468 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ACAD11Q709F0 780 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SLC4A9Q96Q91 983 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 KAT6AQ92794 2004 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 HSPA1LP34931 641 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PSMD7P51665 324 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRR-201ENST00000283228 PTK6Q13882 451 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms