RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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CCDC7-201ENST00000277657 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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CCDC7-201ENST00000277657 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.49■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.49■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 ACLYP53396 1101 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.48■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.48■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 PARP2Q9UGN5 583 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.48■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.47■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 CD101Q93033 1021 aa23.47■■□□□ 1.35
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CCDC7-201ENST00000277657 CEP104O60308 925 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 INHAP05111 366 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 TUBBP07437 444 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 BTBD6Q96KE9 485 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 CARD9Q9H257 536 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 LHX5Q9H2C1 402 aa23.47■■□□□ 1.35
CCDC7-201ENST00000277657 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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