RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC18A3Q16572 532 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS36Q86VN1 386 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHC3Q92529 594 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KAT5Q92993 513 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.084e-7■■■■□ 24.4
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LCHNA4D1U4 455 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPEF2O14830 753 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNNC2P02585 160 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYOGP15173 224 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCOA4Q13772 614 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TATDN2Q93075 761 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DPP3Q9NY33 737 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DERAQ9Y315 318 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLL1O43897 1013 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMP8BP34820 402 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PBX3P40426 434 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BEST2Q8NFU1 509 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A087X0T9 212 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F8W810 466 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITGB3P05106 788 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM228BP0C875 321 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGEA1P43355 309 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC43Q8N309 656 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF18AQ8NI77 898 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAD9AQ99638 391 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIX4Q9UIU6 781 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT86O43790 486 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF5CO60282 957 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT19P08727 400 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DSC1Q08554 894 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TUSC3Q13454 348 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDHQ8IZJ6 230 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXorf38Q8TB03 319 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF592Q92610 1267 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRO3102Q9H379 93 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CWH43Q9H720 699 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INSL6Q9Y581 213 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLCNKBP51801 687 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNG11P61952 73 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF5AQ12840 1032 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYT11Q9BT88 431 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH10P35580 1976 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RCCD1A6NED2 376 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PJA2O43164 708 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF15O94989 841 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP3A5P20815 502 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PBX2P40425 430 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRPC3Q13507 836 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAI1Q9UI46 699 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms