RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 F9P00740 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 TSHRP16473 764 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 ATL2Q8NHH9 583 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 APBB2Q92870 758 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 C18orf8Q96DM3 657 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 MAP3K7O43318 606 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 SDC4P31431 198 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 JAM2P57087 298 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 DR1Q01658 176 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM270Q6UE05 265 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 CYP3A5P20815 502 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 ADCY2Q08462 1091 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 SV2CQ496J9 727 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 NLRP4Q96MN2 994 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 TLR2O60603 784 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 MESDQ14696 234 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 INSRRP14616 1297 aa8.69□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 PHF2O75151 1096 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 ECM1Q16610 540 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 C7orf31Q8N865 590 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM143Q96AN5 459 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 HDAC11Q96DB2 347 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 GUCY2DQ02846 1103 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPN3-201ENST00000262539 HHATQ5VTY9 493 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 ARMC3Q5W041 872 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 SEPT6Q14141 434 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPN3-201ENST00000262539 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.68□□□□□ -1.02
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