RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 SOAT1P35610 550 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 NSL1Q96IY1 281 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 HIC2Q96JB3 615 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 SH3GL1Q99961 368 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 LY9Q9HBG7 655 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ZNF839A8K0R7 811 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CRKP46108 304 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PHKG1Q16816 387 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ADGRF4Q8IZF3 695 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 GGT7Q9UJ14 662 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 STRNO43815 780 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ERFP50548 548 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.93□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CITO14578 2027 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 DSG1Q02413 1049 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 STX5Q13190 355 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ARMCX4Q5H9R4 360 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 KRT77Q7Z794 578 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 B2RBV5 119 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CYP26A1O43174 497 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TADA2AO75478 443 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 E7ENQ6 273 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PDXKO00764 312 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 LARGE1O95461 756 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PDK1Q15118 436 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 LONRF1Q17RB8 773 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 IL31Q6EBC2 164 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 MTA3Q9BTC8 594 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ALDH1A2O94788 518 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 VHLP40337 213 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PRIM2P49643 509 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 KYNUQ16719 465 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PI16Q6UXB8 463 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 WRNIP1Q96S55 665 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PTCH1Q13635 1447 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 RBP5P82980 135 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 BFSP2Q13515 415 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 GPR141Q7Z602 305 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 LINC00523Q86TU6 105 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 RNF146Q9NTX7 359 aa11.92□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 NBPF26B4DH59 902 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ACADSP16219 412 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 COPAP53621 1224 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TLK2Q86UE8 772 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 NBPF15Q8N660 670 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TRIM13O60858 407 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 POU4F1Q01851 419 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CCDC126Q96EE4 140 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ATP6V1B1P15313 513 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PDGFRAP16234 1089 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ADRM1Q16186 407 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 PDP2Q9P2J9 529 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 MYH8P13535 1937 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 SLC26A4O43511 780 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 ACADSBP45954 432 aa11.91□□□□□ -0.5
THBS1-201ENST00000260356 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms