RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259008.6

BRIP1-201, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIP1, Length 6,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-201ENST00000259008 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 SCLYQ96I15 445 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 WDCPQ9H6R7 721 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 TBK1Q9UHD2 729 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 MYBL1P10243 752 aa6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 KLC3Q6P597 504 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 SLC35F6Q8N357 371 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 AGPAT1Q99943 283 aa6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 VPS28Q9UK41 221 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 CCL16O15467 120 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 CIB2O75838 187 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 STX2P32856 288 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 SERPINB6P35237 376 aa6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 TFDP2Q14188 446 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ADCY6O43306 1168 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PALMO75781 387 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 RTP1P59025 263 aa6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 DDIT4Q9NX09 232 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 BTBD7Q9P203 1132 aa6.7□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ZBTB39O15060 712 aa6.69□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 24.9
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BRIP1-201ENST00000259008 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.69□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 C4orf19Q8IY42 314 aa6.69□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.69□□□□□ -1.34
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BRIP1-201ENST00000259008 LACTBL1A8MY62 500 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 PRMT2P55345 433 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 TUBB4BP68371 445 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 GRB10Q13322 594 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 MMEL1Q495T6 779 aa6.69□□□□□ -1.34
BRIP1-201ENST00000259008 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.69□□□□□ -1.34
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