RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc15Q8C9M2 810 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Defb19Q8K3I8 83 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slamf8Q9D3G2 278 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nr3c1P06537 783 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mybl1P51960 751 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ItpripQ3TNL8 555 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mpp4Q6P7F1 635 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Olfr670Q7TRP3 312 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ube2q1Q7TSS2 422 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nop53Q8BK35 484 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zswim3Q8CFL8 695 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MiosQ8VE19 875 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lztr1Q9CQ33 837 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pcyox1Q9CQF9 505 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Arid3bQ9Z1N7 568 aa27.36■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Top1Q04750 767 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trim37Q6PCX9 961 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gprc5aQ8BHL4 356 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem220Q8BP07 167 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Serpina3bQ8BYY9 420 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Efl1Q8C0D5 1127 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dph5Q9CWQ0 281 aa27.35■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dpysl4O35098 572 aa27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Abcb1bP06795 1276 aa27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm11487Q5RIS0 354 aa27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Olfr389Q7TRX7 312 aa27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ttc39bQ8BYY4 617 aa27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Med7Q9CZB6 233 aa27.34■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ptp4a2O70274 167 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Wdtc1Q80ZK9 677 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gga1Q8R0H9 635 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Plekhh3Q8VCE9 796 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stx17Q9D0I4 301 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MicalclQ9D5U9 680 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc91Q9D8L5 442 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Doc2gQ9ESN1 387 aa27.33■■□□□ 1.97
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sox8Q04886 464 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ndst1Q3UHN9 882 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nlrc4Q3UP24 1024 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lrfn2Q80TG9 788 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CyldQ80TQ2 952 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam205cQ80YD3 371 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Usp38Q8BW70 1042 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zdhhc3Q8R173 299 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tlr6Q9EPW9 795 aa27.33■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nlrc5C3VPR6 1915 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup10A2BIN1 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup14A2CEK7 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup19A9C497 187 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup15A9R9W0 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup17B5X0G2 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup8E9PVW0 235 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Myo1eE9Q634 1107 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup7E9QA79 235 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm3383J3QQ59 259 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Casp14O89094 257 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup6P02762 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup1P11588 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mup2P11589 180 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cdr2P97817 455 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Smpd1Q04519 627 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trip13Q3UA06 432 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 H6pdQ8CFX1 789 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tbx22Q8K402 517 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Alas1Q8VC19 642 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Krt17Q9QWL7 433 aa27.32■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa27.31■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trim30bE9PVL6 203 aa27.31■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kcnj4P52189 445 aa27.31■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ppm1jQ149T7 507 aa27.31■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Vps33aQ9D2N9 598 aa27.31■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ZxdbA2CE44 873 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm14525B1AZA0 212 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm2012B1B0R1 212 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zfp658Q5PPQ4 887 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm14819Q62478 212 aa27.3■■□□□ 1.96
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.7 ms