RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde6bP23440 856 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ugt1a2P70691 533 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan2Q07230 614 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sppl2bQ3TD49 578 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smcr8Q3UMB5 935 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ugt1a9Q62452 528 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ugt1a1Q63886 535 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 VwdeQ6DFV8 926 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tubb2aQ7TMM9 445 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp38Q8BW70 1042 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 ClmnQ8C5W0 1052 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uba3Q8C878 462 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctage5Q8R311 779 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itgbl1Q8VDV0 494 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tubb2bQ9CWF2 445 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gstt4Q9D4P7 240 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem86aQ9D8N3 241 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc4a11A2AJN7 862 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim30bE9PVL6 203 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r17E9PYF5 849 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem265E9Q8G3 109 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 XlrP05531 208 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myl1P05977 188 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc12a1P55014 1095 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dlg3P70175 849 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plk1Q07832 603 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klra5Q60652 266 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atg9bQ6EBV9 922 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp397Q7TNK4 527 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rd3Q8BRE0 195 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpv6Q91WD2 767 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 DarsQ922B2 501 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 IscuQ9D7P6 168 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdclQ9DBX2 301 aa12.5□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Veph1A1A535 833 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm1661E9Q963 441 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 SftpdP50404 374 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ect2Q07139 913 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neto2Q8BNJ6 525 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc15Q8C9M2 810 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc28Q8VCE1 385 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clstn3Q99JH7 956 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mroh4G3X8W1 983 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrphP15331 475 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sesn2P58043 480 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 P3h1Q3V1T4 739 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim21Q62191 470 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas2r125Q7M710 311 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vopp1Q8R1C3 172 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slamf8Q9D3G2 278 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Llcfc1Q9D9P8 108 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo17Q9QZM8 286 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Galk1Q9R0N0 392 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf1Q80UV9 1891 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfr2E9Q5M4 874 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r77L7N2B7 854 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rdh7O88451 316 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd44P15379 778 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps51Q3UVL4 782 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Odr4Q4PJX1 447 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp251Q6PCX8 632 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brat1Q8C3R1 822 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem145Q8C4U2 746 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 MiosQ8VE19 875 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Thap12Q9CUX1 758 aa12.49□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm27029A2A4P4 543 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10721J3QPJ9 223 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nek10Q3UGM2 1111 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1046Q7TR79 316 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Daam2Q80U19 1115 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ero1aQ8R180 464 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 PirQ9D711 290 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mgea5Q9EQQ9 916 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 CenphQ9QYM8 241 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 SpdyaQ5IBH7 310 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 UrgcpQ5NCI0 926 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 SugctQ7TNE1 436 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcp10aQ80W76 438 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5591Q8CDK1 855 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 IntS13Q8QZV7 732 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 DgkeQ9R1C6 564 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Anapc7Q9WVM3 565 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm4756A0A140LIS8 335 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm12394A2AKP6 982 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 LipeP54310 759 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 CochQ62507 552 aa12.48□□□□□ -0.41
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.5 ms