RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cacng4Q9JJV4 327 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cntnap4Q99P47 1310 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc35g2D3YVE8 412 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim30bE9PVL6 203 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm3383J3QQ59 259 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 AdkP55264 361 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd163Q2VLH6 1121 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim43aQ3TL54 445 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nlrc4Q3UP24 1024 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm11487Q5RIS0 354 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q66JV7 365 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr670Q7TRP3 312 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr389Q7TRX7 312 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 CyldQ80TQ2 952 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Haus1Q8BHX1 278 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Serpina3bQ8BYY9 420 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam78aQ8C552 283 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pcyox1Q9CQF9 505 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Doc2gQ9ESN1 387 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 IdeQ9JHR7 1019 aa17.1■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Btnl4A2CG29 586 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm3739L7N296 216 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dpysl4O35098 572 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Enc1O35709 589 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ptp4a2O70274 167 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Casp14O89094 257 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 MycP01108 439 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 XlrP05531 208 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nr3c1P06537 783 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tagap1P0CAX8 505 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sparcl1P70663 650 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ugt1a2P70691 533 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Emc10Q3TAS6 258 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttf2Q5NC05 1138 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp658Q5PPQ4 887 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc125Q5U465 500 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ugt1a1Q63886 535 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fgfr1opQ66JX5 399 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdtc1Q80ZK9 677 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttc39bQ8BYY4 617 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Llcfc1Q9D9P8 108 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 PdclQ9DBX2 301 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mta2Q9R190 668 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Plxna1P70206 1894 aa17.09■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc63A6H694 637 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gjb3P28231 270 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmprss15P97435 1069 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ndst1Q3UHN9 882 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 P3h1Q3V1T4 739 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tsr1Q5SWD9 803 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp38Q8BW70 1042 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Efl1Q8C0D5 1127 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gga1Q8R0H9 635 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zdhhc3Q8R173 299 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdzd4Q9QY39 772 aa17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adam19O35674 920 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rps6ka1P18653 724 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 FpgsP48760 587 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 ChpfQ6IQX7 774 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mpp4Q6P7F1 635 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 ClmnQ8C5W0 1052 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Wdr11Q8K1X1 1223 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cpne8Q9DC53 577 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt17Q9QWL7 433 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Galk1Q9R0N0 392 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc73B2RWC4 316 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 CaluO35887 315 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Btg4O70552 250 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abcb1bP06795 1276 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 CochQ62507 552 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kctd15Q8K0E1 283 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc91Q9D8L5 442 aa17.07■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm28919A0A087WP35 240 aa17.06■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa17.06■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm13941A2AJ38 245 aa17.06■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 CcnoP0C242 352 aa17.06■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mybl1P51960 751 aa17.06■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tfap2bQ61313 459 aa17.06■□□□□ 0.32
Casq1-201ENSMUST00000003554 VwdeQ6DFV8 926 aa17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms