RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AmphQ7TQF7 686 aa18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ClasrpQ8CFC7 668 aa18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ErmapQ9JLN5 566 aa18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Anapc7Q9WVM3 565 aa18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gon4lQ9DB00 2260 aa18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef10Q8C033 1345 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lonrf1D3YY23 762 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Has3O08650 554 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trove2O08848 538 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsd17b2P51658 381 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GclcP97494 637 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrp4fQ66X05 959 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Heatr3Q8BQM4 679 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Haus3Q8QZX2 570 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MgarpQ8VI64 283 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcs1lQ9CZP5 418 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DpysQ9EQF5 519 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rdh14Q9ERI6 334 aa18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Impa1O55023 277 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apba3O88888 571 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rag1P15919 1040 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptgs2Q05769 604 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plk1Q07832 603 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FaxcQ3UMF9 409 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dzip1lQ499E4 774 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Srd5a1Q68FF9 255 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vat1lQ80TB8 417 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf879Q8BI99 563 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Azin2Q8BVM4 459 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmed5Q9CXE7 229 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcb11Q9QY30 1321 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mageb2A2AHM0 380 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lipo2D3YY49 398 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp715G3X9T1 886 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klrb1Q0ZUP1 214 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kmt5aQ2YDW7 349 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankmy2Q3TPE9 440 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tdpoz2Q717B2 364 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Impg2Q80XH2 1243 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cabs1Q8C633 391 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apol7cQ8C6E1 369 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab44Q8CB87 725 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif9Q9WV04 790 aa18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11549A0A286YD83 63 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taf1bP97358 586 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lipo3Q3UT41 399 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdtc1Q80ZK9 677 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdha3Q91Y16 942 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdha10Q91Y20 946 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nt5c1bQ91YE9 573 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HlcsQ920N2 722 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 St13Q99L47 371 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adrm1Q9JKV1 407 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AspgA0JNU3 564 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tubb1A2AQ07 451 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp8O09112 663 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SfnO70456 248 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VcpQ01853 806 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MregQ6NVG5 214 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf579Q80VM4 562 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nudt5Q9JKX6 218 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan4dA7KBS4 506 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp4f40G3UW81 524 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlk2O55047 718 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pde4aO89084 844 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psen1P49769 467 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GsapQ3TCV3 858 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan4fQ3URS2 506 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan4cQ80VJ6 506 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Armc9Q9D2I5 817 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsmce1Q9D720 266 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 XkQ9QXY7 446 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hao1Q9WU19 370 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tldc2A2ACG1 198 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbp3P49194 1234 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb14Q08376 449 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf507Q6ZPY5 941 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddhd1Q80YA3 547 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf428Q8C1M2 176 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndfip2Q91ZP6 311 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Terb2Q9D494 218 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SerhlQ9EPB5 311 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PorcnQ9JJJ7 461 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgf15O35622 218 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms