RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	DGK1	Q12382	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	AGC1	Q12482	902 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	ATG40	Q99325	256 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	BLM10	P43583	2143 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	ERV1	P27882	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	ERG2	P32352	222 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	MCH2	P36032	473 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	EGT2	P42835	1041 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YJR012C	P47087	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YJR056C	P47115	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	TIM21	P53220	239 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	ATG4	P53867	494 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YDC1	Q02896	317 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	RCE1	Q03530	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	HRD1	Q08109	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	AGA2	P32781	87 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	RIB5	P38145	238 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	FIG1	P38224	298 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	TRS20	P38334	175 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	YIP5	P53108	310 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
BUD22	YMR014W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MNS1	P32906	549 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAC2	P39937	518 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YIL169C	P40442	995 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	FRE8	Q12209	686 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RIP1	P08067	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PCL1	P24867	279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	CLB6	P32943	380 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
BUD22	YMR014W	YMR262W	P38430	313 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RMD6	P39975	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PIG2	P40187	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	TAF4	P50105	388 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YGL262W	P53054	175 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MRP51	Q02950	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	GMC1	Q04399	608 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	HOF1	Q05080	669 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	LIP2	Q06005	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RAF1	Q06891	181 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	LSB5	P25369	354 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	IMP1	P28627	190 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MRPS9	P38120	278 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SWD3	P38123	315 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	WSS1	P38838	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YER084W	P40057	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	COX15	P40086	486 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU15	P40585	124 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	TTI2	P47168	421 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SIP18	P50263	79 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MGA1	P53050	456 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPN14	P53196	417 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PDR17	P53844	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ADD37	Q03233	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ECM18	Q04623	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	DXO1	Q06349	442 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	FCY22	Q12119	530 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PRR2	Q12310	699 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	COA2	Q3E823	68 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MSI1	P13712	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YMR31	P19955	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	QCR9	P22289	66 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	POP5	P28005	173 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	LAC1	P28496	418 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MRPS5	P33759	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SUR2	P38992	349 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	FLX1	P40464	311 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PHS1	P40857	217 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU4	P53427	120 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SNO1	Q03144	224 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	TSA2	Q04120	196 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	FIT3	Q08907	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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