RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	TRABD	Q9H4I3	376 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SPIN3-222	ENST00000639482	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A1W2PPM1	405 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CDH16	O75309	829 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SATB1	Q01826	763 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DAW1	Q8N136	415 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CHKB	Q9Y259	395 aa		10.65	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GM2A	P17900	193 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MAGEA4	P43358	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TUB	P50607	506 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RIPK1	Q13546	671 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	UGCG	Q16739	394 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM13C	Q8NE31	585 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FIZ1	Q96SL8	496 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ICAM1	P05362	532 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CIITA	P33076	1130 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MFAP3	P55082	362 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	POLE2	P56282	527 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GPS1	Q13098	491 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF394	Q53GI3	561 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ADM5	C9JUS6	153 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TBC1D12	O60347	775 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ITIH2	P19823	946 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MTFR1	Q15390	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TBX3	O15119	743 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TP73	O15350	636 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	CFH	P08603	1231 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PIDD1	Q9HB75	910 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFAT	Q9P243	1243 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	FZD9	O00144	591 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K13	O43283	966 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPRA	P18433	802 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-222	ENST00000639482	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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