RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SNF8	Q96H20	258 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MTFR1L	Q9H019	292 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CREB1	P16220	341 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	IVD	P26440	423 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	VGLL4	Q14135	290 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC14	Q15048	493 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	WHRN	Q9P202	907 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ADCY3	O60266	1144 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	AGT	P01019	485 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GJB1	P08034	283 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	WEE2	P0C1S8	567 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ITIH2	P19823	946 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ABCD1	P33897	745 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MYL6	P60660	151 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ICAM3	P32942	547 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TBK1	Q9UHD2	729 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PIGR	P01833	764 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PGK2	P07205	417 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DRD4	P21917	467 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152		F8VP50	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CP	P00450	1065 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ENPEP	Q07075	957 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PTP4A2	Q12974	167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PTK6	Q13882	451 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	ARIH2	O95376	493 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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