RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TLE2Q04725 743 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM60Q495X7 471 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf76Q5T2E6 689 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf57Q5W0N0 161 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDR2Q01850 454 aa26.64■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF677Q86XU0 584 aa26.63■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 PALB2Q86YC2 1186 aa26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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CAPNS1-215ENST00000628018 WNT8AQ9H1J5 351 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 CALCAP01258 141 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPLA4P41247 253 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SCNN1GP51170 649 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF560Q96MR9 790 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 PACSIN1Q9BY11 444 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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