RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB39O15060 712 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SPTLC1O15269 473 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CYP26A1O43174 497 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC22O60826 627 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 E2F6O75461 281 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 STKLD1Q8NE28 680 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 C17orf50Q8WW18 174 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PNMA5Q96PV4 448 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MIS12Q9H081 205 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ITGB4P16144 1822 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 VILLO15195 856 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ADCY3O60266 1144 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TTLL1O95922 423 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 VCAM1P19320 739 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 AQP4P55087 323 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CYP4A11Q02928 519 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KDSRQ06136 332 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MAPK6Q16659 721 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf183Q5T699 404 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KLC3Q6P597 504 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SMYD1Q8NB12 490 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 THTPAQ9BU02 230 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP29Q9HBJ7 922 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NARFQ9UHQ1 456 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ALG6Q9Y672 507 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 VCANP13611 3396 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPM1 405 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 B2RBV5 119 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 E9PMD0 336 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ITGA8P53708 1063 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 EMP3P54852 163 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MTTPP55157 894 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KRT17Q04695 432 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC63Q05C16 580 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 GSTA3Q16772 222 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 AOC3Q16853 763 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ILDR2Q71H61 639 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 GAB3Q8WWW8 586 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RAD54LQ92698 747 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ART4Q93070 314 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CD209Q9NNX6 404 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 STK17AQ9UEE5 414 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM247A6NEH6 219 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MEI4A8MW99 385 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LRRN2O75325 713 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 STAMBPO95630 424 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TTC4O95801 387 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NAA20P61599 178 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 JAG1P78504 1218 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 GSTM4Q03013 218 aa8.65□□□□□ -1.02
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