RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 DACH1Q9UI36 760 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 LACTBL1A8MY62 500 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 STX10O60499 249 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 PEX14O75381 377 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 PROZP22891 400 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 DSC1Q08554 894 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 NAB2Q15742 525 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM171A1Q5VUB5 890 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ERICH4A6NGS2 130 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 EFCAB8A8MWE9 144 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 CASQ1P31415 396 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXD13P35453 343 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 MTF1Q14872 753 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB2Q96Q27 587 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 DLL1O00548 723 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAM12O43184 909 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 NFICP08651 508 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 PPM1AP35813 382 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 ARPP19P56211 112 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 STX17P56962 302 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2BQ00403 316 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 FUT10Q6P4F1 479 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF12Q96FN5 646 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 CD320Q9NPF0 282 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC1BQ9P126 229 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGEF1-209ENST00000607882 USP34Q70CQ2 3546 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 GRM5P41594 1212 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PLCB3Q01970 1234 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIK3Q13003 919 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 STK4Q13043 487 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TUSC3Q13454 348 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX35Q5T0J7 233 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX27Q96L92 541 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TIPINQ9BVW5 301 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 216.6
RABGEF1-209ENST00000607882 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP83Q9Y592 693 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX33O43247 280 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 MCF2P10911 925 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2G4AP47712 749 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2J2P51589 502 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBP1Q9H171 429 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX28O15482 410 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM189A1O60320 539 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 KLRC2P26717 231 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2R3AQ06190 1150 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 MCL1Q07820 350 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 MTA1Q13330 715 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 JADE1Q6IE81 842 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIML1Q8N9V2 468 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 CITO14578 2027 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0B4J269 797 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 RFPL2O75678 378 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R37O75864 691 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TKTP29401 623 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 NR1I3Q14994 352 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 ZPBP2Q6X784 338 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 13.1
RABGEF1-209ENST00000607882 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 MRFAP1Q9Y605 127 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GTH6 734 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 BMP1P13497 986 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-209ENST00000607882 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms