RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM3CQ92520 227 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ASAH2Q9NR71 780 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 YIPF1Q9Y548 306 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NCANO14594 1321 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ARNTLO00327 626 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF263O14978 683 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN3O15551 220 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 OAZ2O95190 189 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 VNN2O95498 520 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NEFLP07196 543 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCL8P10145 99 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MYL4P12829 197 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GJA1P17302 382 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TGM1P22735 817 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LRPAP1P30533 357 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CCR3P51677 355 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SMTNP53814 917 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NRLP54845 237 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LMNB2Q03252 620 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2R5DQ14738 602 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TEAD2Q15562 447 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 HYIQ5T013 277 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MFSD6LQ8IWD5 586 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR88Q9GZN0 384 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC25Q9H1X3 360 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC26A0AVF1 554 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4Q2P0C623 313 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRNB1P11230 501 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGAP8P85298 464 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SPAG1Q07617 926 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PLD1Q13393 1074 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB6Q15916 424 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TMC8Q8IU68 726 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 E2F7Q96AV8 911 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF12Q96FN5 646 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MSANTD3Q96H12 275 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC3Q9BY71 257 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 USP18Q9UMW8 372 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TSC2P49815 1807 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PRU2 124 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6C75A6NL08 312 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CLTAP09496 248 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP3A5P20815 502 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNE1P24864 410 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFSF9P41273 254 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC12A3P55017 1021 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP4Q13115 394 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR17Q13304 367 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 GAS6Q14393 721 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 USP37Q86T82 979 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNN1Q92952 543 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 RSPRY1Q96DX4 576 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PNMA5Q96PV4 448 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 KCND2Q9NZV8 630 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-226ENST00000593200 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms