RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589823.6

VMP1-210, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene VMP1, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-210ENST00000589823 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.65□□□□□ -0.06
VMP1-210ENST00000589823 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 LGALS16A8MUM7 142 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 ITGB1P05556 798 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 P4HA1P13674 534 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 BRCC3P46736 316 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 TNNC1P63316 161 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 SPRED2Q7Z698 418 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 SUSD3Q96L08 255 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 SENP8Q96LD8 212 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 GCNT4Q9P109 453 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.64□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 CYB561D2O14569 222 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 SPTLC1O15269 473 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-210ENST00000589823 PLCB2Q00722 1185 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 UBXN1Q04323 297 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 UBE3AQ05086 875 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-210ENST00000589823 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-210ENST00000589823 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.63□□□□□ -0.07
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VMP1-210ENST00000589823 GRM6O15303 877 aa14.6□□□□□ -0.07
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VMP1-210ENST00000589823 SLC9A1P19634 815 aa14.6□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 TYMPP19971 482 aa14.6□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 FGFR3P22607 806 aa14.6□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 PON1P27169 355 aa14.6□□□□□ -0.07
VMP1-210ENST00000589823 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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