RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 RTL10Q7L3V2 364 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 PALB2Q86YC2 1186 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 ZNF516Q92618 1163 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 INTS13Q9NVM9 706 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.78■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 OR1D2P34982 312 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 CYP24A1Q07973 514 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 UVSSAQ2YD98 709 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 SENP8Q96LD8 212 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 SFXN1Q9H9B4 322 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 CDH22Q9UJ99 828 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.77■□□□□ 0.28
BECN1-211ENST00000589636 MAPK13O15264 365 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ZMYND10O75800 440 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 POU2F2P09086 479 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 HOXA9P31269 272 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MCM4P33991 863 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 APPL2Q8NEU8 664 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 FAM84AQ96KN4 292 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DPP7Q9UHL4 492 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.76■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 WDR27A2RRH5 827 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 H7C4K7 107 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 VNN2O95498 520 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SPATA31D3P0C874 917 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ATF2P15336 505 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 BMP6P22004 513 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CA8P35219 290 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MTHFRP42898 656 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 UBE2HP62256 183 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ROR1Q01973 937 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CENPPQ6IPU0 288 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 WDR49Q8IV35 697 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 GJD3Q8N144 294 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RTP3Q9BQQ7 232 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 POMKQ9H5K3 350 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 MAFFQ9ULX9 164 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.75■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 NOTCH4Q99466 2003 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 KPNA7A9QM74 516 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TNFRSF10AO00220 468 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RFPL2O75678 378 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 KIF20AO95235 890 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 PRCPP42785 496 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CASP4P49662 377 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TAF6P49848 677 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CYP2J2P51589 502 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ENPEPQ07075 957 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TPGS2Q68CL5 300 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 RDH13Q8NBN7 331 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 APOL5Q9BWW9 433 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 TSC2P49815 1807 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 NR3C1P04150 777 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 ITGB3P05106 788 aa16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
BECN1-211ENST00000589636 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms