RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 C4orf46Q504U0 113 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 TDHQ8IZJ6 230 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MIER2Q8N344 545 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MYOTQ9UBF9 498 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 VAV3Q9UKW4 847 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 EDARQ9UNE0 448 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 GAKO14976 1311 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 TTC28Q96AY4 2481 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PRR19A6NJB7 356 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 A6NNZ2 444 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFS2O75306 463 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ATP5JP18859 108 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 BTDP43251 543 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 IKZF1Q13422 519 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 LILRA6Q6PI73 481 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 Q7L0L9 218 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 HPS3Q969F9 1004 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 IDI2Q9BXS1 227 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RNF38Q9H0F5 515 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 USP40Q9NVE5 1235 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ENTPD3O75355 529 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CHGBP05060 677 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 POU2F2P09086 479 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CD96P40200 585 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 HTR3AP46098 478 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RGS3P49796 1198 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 KIR3DS1Q14943 382 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 C7orf31Q8N865 590 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 NUP43Q8NFH3 380 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 POFUT1Q9H488 388 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RPTORQ8N122 1335 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 NOTOA8MTQ0 251 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 PMM2O15305 246 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MMEP08473 750 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MYBP10242 640 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SYN1P17600 705 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RHCEP18577 417 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MX1P20591 662 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 GSTO1P78417 241 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 RHDQ02161 417 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 TREML2Q5T2D2 321 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATG4D-210ENST00000588972 E2F7Q96AV8 911 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms