RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 MLH1P40692 756 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF132P52740 706 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 FAAP100Q0VG06 881 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM60Q495X7 471 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.88■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM10Q9UDY6 481 aa27.88■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 TNNT1P13805 278 aa27.87■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC122Q5T0U0 273 aa27.86■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 C10orf76Q5T2E6 689 aa27.86■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.85■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 RSAD1Q9HA92 442 aa27.85■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 MIOSQ9NXC5 875 aa27.85■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 RAP1GAPP47736 663 aa27.84■■■□□ 2.05
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SCAMP4-210ENST00000588555 SCNN1GP51170 649 aa27.82■■■□□ 2.04
SCAMP4-210ENST00000588555 TNNC1P63316 161 aa27.82■■■□□ 2.04
SCAMP4-210ENST00000588555 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
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SCAMP4-210ENST00000588555 TXLNBQ8N3L3 684 aa27.82■■■□□ 2.04
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
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