RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-208ENST00000579743 SPAG1Q07617 926 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TWF1Q12792 350 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ZBTB6Q15916 424 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SPATA1Q5VX52 437 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SV2BQ7L1I2 683 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 DNASE1L2Q92874 299 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 IRF7Q92985 503 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 E2F7Q96AV8 911 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 BRD9Q9H8M2 597 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.88□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 FAM170BA6NMN3 283 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MAN2B1O00754 1011 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 LAMTOR5O43504 91 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MYL4P12829 197 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 GAP43P17677 238 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TNFSF9P41273 254 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 CUL4AQ13619 759 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MYBPC2Q14324 1141 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ITIH5Q86UX2 942 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 YAF2Q8IY57 180 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SMARCD2Q92925 531 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 FOXQ1Q9C009 403 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ASB3Q9Y575 518 aa14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ADRB2P07550 413 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 CEBPBP17676 345 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 LILRA4P59901 499 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 GPR17Q13304 367 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TAF12Q16514 161 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 JADE1Q6IE81 842 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 DYMQ7RTS9 669 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ADSSL1Q8N142 457 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SENP8Q96LD8 212 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 C2CD2Q9Y426 696 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.86□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 IL18RAPO95256 599 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 PSMC3P17980 439 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SMARCB1Q12824 385 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ALCAMQ13740 583 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 PPP2R5DQ14738 602 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 VEPH1Q14D04 833 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 EPSTI1Q96J88 318 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ASB16Q96NS5 453 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 GCNAQ96QF7 691 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 ACCSQ96QU6 501 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 YIPF1Q9Y548 306 aa14.85□□□□□ -0.03
GGA3-208ENST00000579743 CLIC4Q9Y696 253 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms