RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579316.5

CSNK1D-211, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-211ENST00000579316 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 RASEFQ8IZ41 740 aa15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TTC8Q8TAM2 541 aa15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TMEM209Q96SK2 561 aa15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 NAV2Q8IVL1 2488 aa15.24■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 APC2O95996 2303 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 LRRIQ4A6NIV6 560 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 WEE1P30291 646 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 GALNT17Q6IS24 598 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 FBXL16Q8N461 479 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 DEFB124Q8NES8 71 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 BEST2Q8NFU1 509 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ADPGKQ9BRR6 497 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 EBF1Q9UH73 591 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 KLK13Q9UKR3 277 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TRIP11Q15643 1979 aa15.23■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 A0A1W2PRU2 124 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 RARRES1P49788 294 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 FGD1P98174 961 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TNK2Q07912 1038 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TPH2Q8IWU9 490 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 BRF1Q92994 677 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 GDAQ9Y2T3 454 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 YIPF1Q9Y548 306 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.22■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ACKR2O00590 384 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 DCLK1O15075 740 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 PTPAQ15257 358 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 MAPK6Q16659 721 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 XKR4Q5GH76 650 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 PMS2CLQ68D20 193 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ZNF280DQ6N043 979 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 Q6ZUG5 572 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 C11orf74Q86VG3 221 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 SKAP1Q86WV1 359 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 CHFRQ96EP1 664 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.21■□□□□ 0.03
CSNK1D-211ENST00000579316 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 H0Y626 953 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 PODXLO00592 558 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 DPYSL4O14531 572 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 RNF40O75150 1001 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 TRIM16O95361 564 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 VNN2O95498 520 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 EDN1P05305 212 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 PLD1Q13393 1074 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 NEK8Q86SG6 692 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 SUSD3Q96L08 255 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 HHIPQ96QV1 700 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 SLC32A1Q9H598 525 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 PRAMEF12O95522 483 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 APBB3O95704 486 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.023e-10■□□□□ 9.9
CSNK1D-211ENST00000579316 MCM2P49736 904 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 GAREM2Q75VX8 874 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 SYT13Q7L8C5 426 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 PIP4P1Q86T03 277 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 POTEDQ86YR6 584 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.19■□□□□ 0.02
CSNK1D-211ENST00000579316 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms