RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB40C-211	ENST00000568586	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	SPTLC1	O15269	473 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	FSHR	P23945	695 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	ASIC1	P78348	528 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	TDG	Q13569	410 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	UNC13D	Q70J99	1090 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	HPS3	Q969F9	1004 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
RAB40C-211	ENST00000568586	EXTL3	O43909	919 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	FBXL6	Q8N531	539 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SENP8	Q96LD8	212 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	KCNH6	Q9H252	994 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	DPP3	Q9NY33	737 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ANHX	E9PGG2	379 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SLFN14	P0C7P3	912 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	CMA1	P23946	247 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	OR6C75	A6NL08	312 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SEC24A	O95486	1093 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	CYP11A1	P05108	521 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ELF1	P32519	619 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	WNT7B	P56706	349 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	NTHL1	P78549	312 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SAAL1	Q96ER3	474 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	CDH7	Q9ULB5	785 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ARPP19	P56211	112 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	KRT85	P78386	507 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	USP37	Q86T82	979 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	BORCS6	Q96GS4	357 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	NOTCH4	Q99466	2003 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	UBE4B	O95155	1302 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	PRRG1	O14668	218 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ODC1	P11926	461 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	MYBPC2	Q14324	1141 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	GPD1L	Q8N335	351 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SPATA32	Q96LK8	384 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	POLI	Q9UNA4	740 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	HPSE	Q9Y251	543 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SCN1A	P35498	2009 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	GPR17	Q13304	367 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	HTR4	Q13639	388 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	CXorf38	Q8TB03	319 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	FGF13	Q92913	245 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	USP25	Q9UHP3	1055 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RAB40C-211	ENST00000568586	TGFB1I1	O43294	461 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	VNN2	O95498	520 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	LRG1	P02750	347 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	CASP1	P29466	404 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	TAF6	P49848	677 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	ADCY1	Q08828	1119 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	CUL4B	Q13620	913 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	ITFG1	Q8TB96	612 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	DSE	Q9UL01	958 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	CPB1	P15086	417 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	PTPN2	P17706	415 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RAB40C-211	ENST00000568586	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		31.75	■■■□□ 2.67

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