RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566286.5

TCF4-232, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TCF4, Length 2,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-232ENST00000566286 WDR18Q9BV38 432 aa11.65□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.65□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SLX4Q8IY92 1834 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ADCY8P40145 1251 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CDR2Q01850 454 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CENPCQ03188 943 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 MGAT5Q09328 741 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 VSIG1Q86XK7 387 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SHC3Q92529 594 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 KIFAP3Q92845 792 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TEKT1Q969V4 418 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 BTBD6Q96KE9 485 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 FAM81BQ96LP2 452 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TMEM237Q96Q45 408 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ACCSQ96QU6 501 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.64□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ZBTB39O15060 712 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 MAGEB2O15479 319 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CYP26A1O43174 497 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 DCTN3O75935 186 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ABHD2P08910 425 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 BMP3P12645 472 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ALDH3A1P30838 453 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SLC1A1P43005 524 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RASSF2P50749 326 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SNAP25P60880 206 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SNX1Q13596 522 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TAF11Q15544 211 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 DOK7Q18PE1 504 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CCDC89Q8N998 374 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SAAL1Q96ER3 474 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 EHMT1Q9H9B1 1298 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CHST7Q9NS84 486 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SIPA1L1O43166 1804 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RASA4BC9J798 803 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ZNF536O15090 1300 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RASA4O43374 803 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 NDUFB10O96000 172 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CYP11B1P15538 503 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 MAPK4P31152 587 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SLC18A1P54219 525 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CYP4X1Q8N118 509 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 DCLK3Q9C098 648 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 EURLQ9NYK6 297 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TBK1Q9UHD2 729 aa11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 A0A1W2PRG0 241 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ABLIM1O14639 778 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CALB2P22676 271 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 NFIAQ12857 509 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 STYK1Q6J9G0 422 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 POTEAQ6S8J7 498 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ZNF365Q70YC5 407 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 DAW1Q8N136 415 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 KAT5Q92993 513 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 LXNQ9BS40 222 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.62□□□□□ -0.55
TCF4-232ENST00000566286 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms