RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561436.1

HERC1-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, human

TSL 4

Gene HERC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC1-215	ENST00000561436	SCNN1G	P51170	649 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	NPEPPS	P55786	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ZXDA	P98168	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	PTH1R	Q03431	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	IL10RA	Q13651	578 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	VPS11	Q9H270	941 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	AFF2	P51816	1311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	B3GALT2	O43825	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	MGEA5	O60502	916 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ITGA10	O75578	1167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	TUSC2	O75896	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FSHB	P01225	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	HRG	P04196	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	GPSM2	P81274	684 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CREM	Q03060	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	SEPT2	Q15019	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	EDA	Q92838	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	GOLIM4	O00461	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	WNT10B	O00744	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	TPP1	O14773	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ADCY6	O43306	1168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FAM20B	O75063	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	RHCE	P18577	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	HK1	P19367	917 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	DDC	P20711	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	SREBF1	P36956	1147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	GZMK	P49863	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	MAP2K6	P52564	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	HK3	P52790	923 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	RHD	Q02161	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	NOG	Q13253	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	CRHR2	Q13324	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	SP140	Q13342	867 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	BIRC2	Q13490	618 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FGL2	Q14314	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HERC1-215	ENST00000561436	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms