RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGER1	P34995	402 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	COPB2	P35606	906 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NRG3	P56975	720 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	IL2	P60568	153 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	GTF2H3	Q13889	308 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD1	Q15116	288 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKS6	Q68DC2	871 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MORC1	Q86VD1	984 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF3	Q86WH2	238 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CPXCR1	Q8N123	301 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A5	Q92911	643 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	GJA10	Q969M2	543 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR8	Q96EF0	704 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		3.44	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	VSTM5	A8MXK1	200 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRT4	C9JH25	899 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGA10	O75578	1167 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CFI	P05156	583 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LPL	P06858	475 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	RBP3	P10745	1247 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MCC	P23508	829 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAT1	P26572	445 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	APBA1	Q02410	837 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MYBPC2	Q14324	1141 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD2	Q14681	263 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM240	Q5SV17	173 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	METRNL	Q641Q3	311 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	DRC7	Q8IY82	874 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX33	Q8WV41	574 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP95	Q96GE4	821 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957		Q96MF0	132 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	AIFM3	Q96NN9	605 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC1	Q99614	292 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT22	Q9H7X7	185 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LUZP4	Q9P127	313 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TNKS	O95271	1327 aa		3.43	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957		B5MCH6	92 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT10B	O00744	389 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF4	O60810	478 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LDHC	P07864	332 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	VCAM1	P19320	739 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSS	P25774	331 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2C19	P33261	490 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LGALS4	P56470	323 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	STRN3	Q13033	797 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CT83	Q5H943	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	DACT2	Q5SW24	774 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ICE2	Q659A1	982 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	IL31	Q6EBC2	164 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR149	Q86SP6	731 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTD1	Q8N815	330 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	NEU1	Q99519	415 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	SPON1	Q9HCB6	807 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		3.42	□□□□□ -1.86
AKAP13-223	ENST00000560957	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		3.42	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms