RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHKBQ93100 1093 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNRHR2Q96P88 292 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 GBP4Q96PP9 640 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRIQ9BWK5 157 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 KAT14Q9H8E8 782 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF181Q9P0P0 153 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 DSEQ9UL01 958 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCHHQ07283 1943 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 FZD9O00144 591 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLF4O43474 513 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOD2P04179 222 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKR1B1P15121 316 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCF3P15923 654 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDCP20941 246 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHMT1P34896 483 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR162Q16538 588 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMTC2Q8N394 836 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 LMF1Q96S06 567 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 IDI2Q9BXS1 227 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SWAP70Q9UH65 585 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 STX8Q9UNK0 236 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTMR6Q9Y217 621 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF3AQ9Y496 699 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNTNAP1P78357 1384 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 BLACEA4D250 179 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 H0Y858 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 OVOL3O00110 214 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 WNT10BO00744 389 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ENTPD3O75355 529 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDKL5O76039 1030 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 GABPAQ06546 454 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 NSMFQ6X4W1 530 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 FANCBQ8NB91 859 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CEP95Q96GE4 821 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 AIFM3Q96NN9 605 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNAJC18Q9H819 358 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 IPPKQ9H8X2 491 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 NID2Q14112 1375 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 H7C1D1 291 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALM1P0DP23 149 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALM2P0DP24 149 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CALM3P0DP25 149 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP51Q70EK9 711 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM151AQ8WW52 585 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 C8orf76Q96K31 380 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.28□□□□□ -1.4
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms