RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CYLD	Q9NQC7	956 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749		R4GN57	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	LILRB5	O75023	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MOSPD3	O75425	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ECI2	O75521	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	B3GAT3	O94766	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MICAL2	O94851	1124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	VNN2	O95498	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNE1	P15382	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TGM1	P22735	817 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MCM7	P33993	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CCR2	P41597	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	BRCC3	P46736	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ID4	P47928	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NPTX2	P47972	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CLCNKB	P51801	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NEK4	P51957	841 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	EFNA5	P52803	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	EPHA5	P54756	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ROR1	Q01973	937 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF174	Q15697	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CEP120	Q8N960	986 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	IRF7	Q92985	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	UROC1	Q96N76	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	KIF2C	Q99661	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CDT1	Q9H211	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	F5	P12259	2224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	ACACB	O00763	2458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC7B-210	ENST00000556749	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ESPN	B1AK53	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749		E9PMD0	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749		I3L4J1	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ARNTL	O00327	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SYN3	O14994	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCL16	O15467	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SPINT1	O43278	529 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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