RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GYG2O15488 501 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 SUPT3HO75486 399 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DRAP01903 254 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 FAM200BP0CF97 657 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 CHRNA5P30532 468 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 HADHAP40939 763 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 SLC11A2P49281 568 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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PTPRB-208ENST00000550358 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRB-208ENST00000550358 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.91□□□□□ -0.98
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