RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.62■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 USP27XA6NNY8 438 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 MAGEB2O15479 319 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R37O75864 691 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 DAW1Q8N136 415 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 CLCN3P51790 818 aa21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 UGCGQ16739 394 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 DRC1Q96MC2 740 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 MYADMQ96S97 322 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 FOXQ1Q9C009 403 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 LILRB3O75022 631 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 STBD1O95210 358 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 TMOD1P28289 359 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBED6P86452 979 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 SHDQ96IW2 340 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.6■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 SFI1A8K8P3 1242 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 TGFB1I1O43294 461 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 LAMTOR5O43504 91 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 PLS3P13797 630 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 DPP7Q9UHL4 492 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-204ENST00000548823 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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CTDSP2-204ENST00000548823 HVCN1Q96D96 273 aa21.58■■□□□ 1.04
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CTDSP2-204ENST00000548823 EPC1Q9H2F5 836 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 CHST12Q9NRB3 414 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 ANHXE9PGG2 379 aa21.57■■□□□ 1.04
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