RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548211.1

RPAP3-205, Transcript of RNA polymerase II associated protein 3, human

TSL 2

Gene RPAP3, Length 555 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ATP10A	O60312	1499 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	PROK1	P58294	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SLFN5	Q08AF3	891 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	HECW1	Q76N89	1606 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TOM1	O60784	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	GPR32	O75388	356 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	MTHFD2	P13995	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ABCG1	P45844	678 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	MTM1	Q13496	603 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ANO4	Q32M45	955 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	LNX2	Q8N448	690 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DPF2	Q92785	391 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	NCOA1	Q15788	1441 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ENDOD1	O94919	500 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	FCER1A	P12319	257 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC6A4	P31645	630 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	MGAT2	Q10469	447 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	STAT4	Q14765	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TBX22	Q9Y458	520 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	C3	P01024	1663 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	PEX1	O43933	1283 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	PRKD3	O94806	890 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ELFN1	P0C7U0	828 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DDC	P20711	480 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	MTNR1B	P49286	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	ATP8B2	P98198	1209 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	PNKP	Q96T60	521 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPAP3-205	ENST00000548211	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	EYA4	O95677	639 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	ERBB2	P04626	1255 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	SBK3	P0C264	359 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	GATA3	P23771	443 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	PPM1N	Q8N819	430 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	TFAP2B	Q92481	460 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	RERE	Q9P2R6	1566 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	NPAT	Q14207	1427 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	WIPF3	A6NGB9	483 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	YY2	O15391	372 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	TEX33	O43247	280 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	BRINP1	O60477	761 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	HSPA1L	P34931	641 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	FOLR3	P41439	243 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	MAPK10	P53779	464 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPAP3-205	ENST00000548211	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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