RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TFDP1Q14186 410 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MAPK6Q16659 721 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 H2AFVQ71UI9 128 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HELQQ8TDG4 1101 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 AFG1LQ8WV93 481 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KAT5Q92993 513 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NT5C1BQ96P26 610 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TRIM4Q9C037 500 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TSKSQ9UJT2 592 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MYH10P35580 1976 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 COL1A2P08123 1366 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 A6NHS1 94 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ENO4A6NNW6 628 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SMAPO00193 183 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 11
CS-204ENST00000546621 MAGEB2O15479 319 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CLDN3O15551 220 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ASAP2O43150 1006 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TOM1L1O75674 476 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PALMO75781 387 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 C22orf31O95567 290 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZNF286BP0CG31 522 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 INSRRP14616 1297 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SMPD1P17405 629 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TNNI1P19237 187 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TNFAIP3P21580 790 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PBX2P40425 430 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CLCN3P51790 818 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 WNT7BP56706 349 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SESN3P58005 492 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SKOR1P84550 965 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GCNT1Q02742 428 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ACVR2BQ13705 512 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 BLMHQ13867 455 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZACNQ401N2 412 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CCDC181Q5TID7 509 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 METTL13Q8N6R0 699 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 SHC3Q92529 594 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ZNF516Q92618 1163 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FAM81BQ96LP2 452 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NLRP4Q96MN2 994 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CGRRF1Q99675 332 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 AGPAT1Q99943 283 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TINF2Q9BSI4 451 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TLR10Q9BXR5 811 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 CPA4Q9UI42 421 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 NCANO14594 1321 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-204ENST00000546621 CREB3O43889 395 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 FAM189A1O60320 539 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 MMP3P08254 477 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TMEM253P0C7T8 217 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PIK3CAP42336 1068 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 TRPC1P48995 793 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 GALCP54803 685 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-204ENST00000546621 PTENP60484 403 aa8.29□□□□□ -1.08
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