RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 XKR3Q5GH77 459 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 FUT10Q6P4F1 479 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ANO5Q75V66 913 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF410Q86VK4 478 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CNNM3Q8NE01 707 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 TCEAL3Q969E4 200 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DYDC2Q96IM9 177 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.77□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 LNP1A1A4G5 178 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 STX6O43752 255 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 RHOBTB1O94844 696 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 GDI1P31150 447 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DNM2P50570 870 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CYP4A11Q02928 519 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 RESTQ13127 1097 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 GRM2Q14416 872 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PDIA5Q14554 519 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ELF2Q15723 593 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ECM1Q16610 540 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PLK5Q496M5 336 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 TPH2Q8IWU9 490 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 C4orf19Q8IY42 314 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DEFB124Q8NES8 71 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ING5Q8WYH8 240 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 B3GALT6Q96L58 329 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 APOL6Q9BWW8 343 aa9.76□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 A0A087WZ62 844 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF263O14978 683 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 RNF40O75150 1001 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 MED24O75448 989 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 MICAL2O94851 1124 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 LYPLA2O95372 231 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 RHOP08100 348 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 FCARP24071 287 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 NPEPPSP55786 919 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 SCAPQ12770 1279 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 DRP2Q13474 957 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PKP1Q13835 747 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 MTERF2Q49AM1 385 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PDXDC1Q6P996 788 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 BRAPQ7Z569 592 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 LXNQ9BS40 222 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.75□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARL5CA6NH57 179 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 LAD1O00515 517 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PLA2G2AP14555 144 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PTPN2P17706 415 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDC25AP30304 524 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PRPHP41219 470 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CREB5Q02930 508 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PTPAQ15257 358 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 Q6ZS52 159 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF605Q86T29 641 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 ASB16Q96NS5 453 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 TTPALQ9BTX7 342 aa9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRAPPC1-202ENST00000540486 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms