RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C7orf31Q8N865 590 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HPS3Q969F9 1004 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARMC5Q96C12 935 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCLT1Q96NL6 688 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 THAP9Q9H5L6 903 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLD4Q9HCU8 107 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FANCLQ9NW38 375 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AKT3Q9Y243 479 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NRCAMQ92823 1304 aa6.12□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KBTBD13C9JR72 458 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM229AH3BQW9 127 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 K7ERI5 159 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC16A4O15374 487 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NDUFB5O43674 189 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CABYRO75952 493 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYBP10242 640 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLRC1P26715 233 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EFNA5P52803 228 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NCKAP1LP55160 1127 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBASH3AP57075 661 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BEX3Q00994 111 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARID5AQ03989 594 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CENPPQ6IPU0 288 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PCGF5Q86SE9 256 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RSPH3Q86UC2 560 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPV1Q8NER1 839 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM143Q96AN5 459 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GBP3Q9H0R5 595 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNTN3Q9P232 1028 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DENND3A2RUS2 1198 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNJ18B7U540 433 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 M0QZ92 97 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADCY5O95622 1261 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PGK1P00558 417 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPM1P09493 284 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAT1P18440 290 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CES1P23141 567 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARL2P36404 184 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLT3P36888 993 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPTX2P47972 431 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GTF2BQ00403 316 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ORC1Q13415 861 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADAM9Q13443 819 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SERINC3Q13530 473 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNJ12Q14500 433 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SARM1Q6SZW1 724 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP37Q86T82 979 aa6.11□□□□□ -1.43
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms