RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 LRRC52Q8N7C0 313 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 TOP1MTQ969P6 601 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM81BQ96LP2 452 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 SNX9Q9Y5X1 595 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 DDHD2O94830 711 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 STAT1P42224 750 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 TAF6P49848 677 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 CRIPAKQ8N1N5 446 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa28.42■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 INPPL1O15357 1258 aa28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 WEE2P0C1S8 567 aa28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 CD58P19256 250 aa28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 PNPLA4P41247 253 aa28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.147e-16■□□□□ 10.3
NDUFS3-211ENST00000533507 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 SCN1AP35498 2009 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 F8VZ95 297 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 GFPT2O94808 682 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 KRT5P13647 590 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 RPL9P32969 192 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 OR1G1P47890 313 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 PANX2Q96RD6 677 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJC7Q99615 494 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.4■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 KPNA7A9QM74 516 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 B3GAT3O94766 335 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 RAP1GAPP47736 663 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 JAM2P57087 298 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 UPP1Q16831 310 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 SV2CQ496J9 727 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM240Q5SV17 173 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa28.39■■■□□ 2.14
NDUFS3-211ENST00000533507 NRDCO43847 1150 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SOX5P35711 763 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 ASPAP45381 313 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CDH8P55286 799 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 LILRA4P59901 499 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 ASIC2Q16515 512 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 HASPINQ8TF76 798 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 UROC1Q96N76 676 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 GPR88Q9GZN0 384 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 VRTNQ9H8Y1 702 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.39■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 DGKIO75912 1065 aa28.38■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SKILP12757 684 aa28.38■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SMYD3Q9H7B4 428 aa28.38■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 LTBP2Q14767 1821 aa28.38■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SPTLC1O15269 473 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 STAU1O95793 577 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 COLGALT2Q8IYK4 626 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 HCSTQ9UBK5 93 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 MYO6Q9UM54 1294 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 B4GALT3O60512 393 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 TMEM270Q6UE05 265 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 DSTYKQ6XUX3 929 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CISHQ9NSE2 258 aa28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF394Q53GI3 561 aa28.36■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 LRRC43Q8N309 656 aa28.36■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.36■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SHC3Q92529 594 aa28.36■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 YME1L1Q96TA2 773 aa28.36■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.36■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 DSC1Q08554 894 aa28.35■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.35■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CHP1Q99653 195 aa28.35■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 AIPL1Q9NZN9 384 aa28.35■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CYP26A1O43174 497 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 HUS1O60921 280 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 ALDH2P05091 517 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC172P0C7W6 258 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 FERP16591 822 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 KLHL30Q0D2K2 578 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR59Q6PJI9 974 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 BCO2Q9BYV7 579 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 KCNF1Q9H3M0 494 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 F8W810 466 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CYB561D2O14569 222 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC112Q8NEF3 446 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 APPL2Q8NEU8 664 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 JAKMIP2Q96AA8 810 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SDCBP2Q9H190 292 aa28.34■■■□□ 2.13
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms