RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TTC1Q99614 292 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 IFT22Q9H7X7 185 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PLCH1Q4KWH8 1693 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 WNK3Q9BYP7 1800 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0A6YYJ9 748 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ANO9A1A5B4 782 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf78A6NCI8 922 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MUSKO15146 869 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 DAPK3O43293 454 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 INSRRP14616 1297 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 BPIFB4P59827 614 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 ALDH1L2Q3SY69 923 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 BROXQ5VW32 411 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 CCDC89Q8N998 374 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SLC5A5Q92911 643 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 NWD2Q9ULI1 1742 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MYPNQ86TC9 1320 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA8BA8MQT2 603 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PRRT4C9JH25 899 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KDM1AO60341 852 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 BPIP17213 487 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CASP2P42575 452 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 DUSP8Q13202 625 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RIN1Q13671 783 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GRM3Q14832 879 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ACAP1Q15027 740 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 MRC1P22897 1456 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PRX2 142 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 CYP27B1O15528 508 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 ID4P47928 161 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ADCY7P51828 1080 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 STK3Q13188 491 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GRM7Q14831 915 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KRT24Q2M2I5 525 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-214ENST00000530727 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KRT40Q6A162 431 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GPR135Q8IZ08 494 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PLA2G15Q8NCC3 412 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM176AQ96HP8 235 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 USP18Q9UMW8 372 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 TNNQ9UQP3 1299 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 JAG2Q9Y219 1238 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 DISP2A7MBM2 1401 aa4.89□□□□□ -1.63
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