RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SPTLC1O15269 473 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF4AO95239 1232 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 P4HA1P13674 534 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 CDC25BP30305 580 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF558Q96NG5 402 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 AAASQ9NRG9 546 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 NOL4O94818 638 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 KLK7P49862 253 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 NUP58Q9BVL2 599 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 GANQ9H2C0 597 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 MARCH5Q9NX47 278 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 LCHNA4D1U4 455 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM163BP0C2L3 166 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 UCHL3P15374 230 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PPM1AP35813 382 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 DPH6Q7L8W6 267 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 NEK11Q8NG66 645 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 RABGGTAQ92696 567 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TATDN2Q93075 761 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SUSD3Q96L08 255 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 BCO2Q9BYV7 579 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 M0QZQ0 153 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAPPC3O43617 180 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 EFEMP2O95967 443 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ITGB1P05556 798 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ASPAP45381 313 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 RABGGTBP53611 331 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PPC1 479 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGEF37A1IGU5 675 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 LINC01553A4QN01 128 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 F8W810 466 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TADA2AO75478 443 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TNNC1P63316 161 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 APBA1Q02410 837 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 LRMPQ12912 555 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 CUL2Q13617 745 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN21Q16825 1174 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 IGSF21Q96ID5 467 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 EPHB6O15197 1021 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM14Q14142 442 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 RAB30Q15771 203 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA18Q8TC71 538 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SENP8Q96LD8 212 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PLVAPQ9BX97 442 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SPG21Q9NZD8 308 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 CEP72Q9P209 647 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 STK39Q9UEW8 545 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1W2PQJ5 194 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TACC1O75410 805 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 PBX3P40426 434 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 SOWAHAQ2M3V2 549 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC39CQ8N584 583 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-205ENST00000528462 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 96.1
PACSIN3-205ENST00000528462 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.58■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 CYB561D2O14569 222 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 HUS1O60921 280 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP11A1P05108 521 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms