RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526445.1

PDE4DIP-222, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EDA	Q92838	391 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TCHH	Q07283	1943 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C8A	P07357	584 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	STK4	Q13043	487 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LIN9	Q5TKA1	542 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FSIP1	Q8NA03	581 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SENP8	Q96LD8	212 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ANK1	P16157	1881 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CLUH	O75153	1309 aa		12.35	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PRR33	A8MZF0	331 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZNF202	O95125	648 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TAF6	P49848	677 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZXDA	P98168	799 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DPYD	Q12882	1025 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SURF1	Q15526	300 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PTPN21	Q16825	1174 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	XYLB	O75191	536 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RHOBTB3	O94955	611 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SEC24A	O95486	1093 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ODC1	P11926	461 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PNPLA4	P41247	253 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GPR17	Q13304	367 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	USP37	Q86T82	979 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	DSE	Q9UL01	958 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CYB561D2	O14569	222 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	CCL16	O15467	120 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	VNN2	O95498	520 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	ELF1	P32519	619 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	RBP5	P82980	135 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	KCNB1	Q14721	858 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	PSMD6	Q15008	389 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PDE4DIP-222	ENST00000526445	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.4 ms