RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.68■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.68■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 LACTBL1A8MY62 500 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 M0QZQ0 153 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 OR4Q2P0C623 313 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 CYP3A5P20815 502 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 LRPAP1P30533 357 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 GUCY2FP51841 1108 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 SMARCD2Q92925 531 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 IRF7Q92985 503 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 TBX20Q9UMR3 447 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 YIPF1Q9Y548 306 aa22.67■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 MAN2B1O00754 1011 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 OAZ2O95190 189 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 GDI1P31150 447 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 PLD1Q13393 1074 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 PARVGQ9HBI0 331 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 OGTO15294 1046 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 SLC26A4O43511 780 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 PSMC3P17980 439 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 VIPR2P41587 438 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 EPHB3P54753 998 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 TEAD2Q15562 447 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 ZBTB6Q15916 424 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 DCLK2Q8N568 766 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 BEST2Q8NFU1 509 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 CLDN23Q96B33 292 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 TRIP11Q15643 1979 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-218ENST00000521865 OR6C75A6NL08 312 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF263O14978 683 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SPTLC1O15269 473 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 TRAK2O60296 914 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SCP2P22307 547 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ALDH1A3P47895 512 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 DUSP4Q13115 394 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 MCM6Q14566 821 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 TSSK4Q6SA08 328 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 VITQ6UXI7 678 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 NCDNQ9UBB6 729 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 NOTCH4Q99466 2003 aa22.64■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 MOSPD3O75425 235 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ODC1P11926 461 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 PLCG1P19174 1290 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 GPR17Q13304 367 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 YAF2Q8IY57 180 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 GPR88Q9GZN0 384 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 A0A1W2PRU2 124 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 PPEF2O14830 753 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 BMP15O95972 392 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 PIGRP01833 764 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 MCM2P49736 904 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 EPHA5P54756 1037 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 MTAPQ13126 283 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SPATA1Q5VX52 437 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 JADE1Q6IE81 842 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 CD302Q8IX05 232 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 FAM3CQ92520 227 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 RAD54LQ92698 747 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 RMDN1Q96DB5 314 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 BORCS6Q96GS4 357 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 A0A0B4J269 797 aa22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 FAM189A1O60320 539 aa22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 TYMPP19971 482 aa22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF131P52739 623 aa22.61■■□□□ 1.21
PABPC1-218ENST00000521865 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms