RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520677.1

MRPL13-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L13, human

TSL 3

Gene MRPL13, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL13-204	ENST00000520677	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	COL4A1	P02462	1669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	LAMB2	P55268	1798 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	CSF1R	P07333	972 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	FGR	P09769	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	GRM1	Q13255	1194 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	IL16	Q14005	1332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	SPIDR	Q14159	915 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	GREM2	Q9H772	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL13-204	ENST00000520677	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CA12	O43570	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	HK1	P19367	917 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	DNM2	P50570	870 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SEC24C	P53992	1094 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	HUNK	P57058	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GCKR	Q14397	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF609	O15014	1411 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GSTA4	O15217	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ADCY3	O60266	1144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MMP14	P50281	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	USP14	P54578	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	NOG	Q13253	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	BEND3	Q5T5X7	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	SNAP23	O00161	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	WNT10B	O00744	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KLF4	O43474	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RECQL4	O94761	1208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	PRL	P01236	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	KLRK1	P26718	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	CTGF	P29279	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	RGS3	P49796	1198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL13-204	ENST00000520677	FKBP1B	P68106	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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