RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 KAT5Q92993 513 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 HIPK3Q9H422 1215 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 RGS18Q9NS28 235 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GIT1Q9Y2X7 761 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 CYP3A5P20815 502 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 KIF11P52732 1056 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PTK2Q05397 1052 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 MYO1EQ12965 1108 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SPA17Q15506 151 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 CXorf38Q8TB03 319 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SEPT8Q92599 483 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 HPDLQ96IR7 371 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 DESI2Q9BSY9 194 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ARL5CA6NH57 179 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 C9IYK1 514 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 CYP26A1O43174 497 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 NBNO60934 754 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 LCA5LO95447 670 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 EOMESO95936 686 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 KRT5P13647 590 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GUCY2FP51841 1108 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 BPIFB4P59827 614 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 FAM189BP81408 668 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GPNMBQ14956 572 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 RNF169Q8NCN4 708 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 APBB2Q92870 758 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 LPPQ93052 612 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ZFP42Q96MM3 310 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 RSAD1Q9HA92 442 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 TMEM39AQ9NV64 488 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 USP27XA6NNY8 438 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ENPP3O14638 875 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PTGESO14684 152 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 THP07101 528 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 CLTBP09497 229 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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TRPS1-210ENST00000519815 CYP2C18P33260 490 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 MLH1P40692 756 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 PNPLA4P41247 253 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SLC18A3Q16572 532 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.17□□□□□ -0.62
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