RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC27Q9C0I9 530 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 SYNCQ9H7C4 482 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 RAD17O75943 681 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 RAB15P59190 212 aa8.96□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 NAB2Q15742 525 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 POTEGQ6S5H5 508 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 TLDC2A0PJX2 215 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 SMIM23A6NLE4 172 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 GMCL1Q96IK5 515 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 KDM1AO60341 852 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.94□□□□□ -0.98
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TRPS1-209ENST00000519674 CYP2W1Q8TAV3 490 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 TSG101Q99816 390 aa8.94□□□□□ -0.98
TRPS1-209ENST00000519674 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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