RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 NXPE1Q8N323 547 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGBD3Q8N328 593 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIML1Q8N9V2 468 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIGA1Q8NAN2 632 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC26Q8TAB7 109 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 LMBR1Q8WVP7 490 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSPH1Q8WYR4 309 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFFLQ8WZ73 363 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 C14orf79Q96F83 325 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 IGSF21Q96ID5 467 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC46A1Q96NT5 459 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CASD1Q96PB1 797 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS6KC1Q96S38 1066 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHF1Q96S99 279 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM209Q96SK2 561 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBP3Q9H0R5 595 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FN3KRPQ9HA64 309 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHST11Q9NPF2 352 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPHK2Q9NRA0 654 aa2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGS18Q9NS28 235 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMG20BQ9P0W2 317 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP10Q9P2G4 905 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 COPG2Q9UBF2 871 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 FOCADQ5VW36 1801 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR81Q562E7 1941 aa2.23□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9IYK1 514 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NFIBO00712 420 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPYSL4O14531 572 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNN4O15554 427 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TGM5O43548 720 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGSF3O75054 1194 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR1I2O75469 434 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGPS1O95749 300 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LGALS2P05162 132 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ICAM1P05362 532 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXC8P31273 242 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HSDL1Q3SXM5 330 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C3orf38Q5JPI3 329 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 MANEAQ5SRI9 462 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYCP2LQ5T4T6 812 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE3BQ5TA77 95 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGF2-ASQ6U949 168 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTHFD1LQ6UB35 978 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC30A10Q6XR72 485 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIAH1Q8IUQ4 282 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 URGCPQ8TCY9 931 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 HELQQ8TDG4 1101 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRGNQ92686 78 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 E2F7Q96AV8 911 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZBTB10Q96DT7 871 aa2.22□□□□□ -2.05
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