RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	SLC16A6	O15403	523 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	CCND1	P24385	295 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	AKAP5	P24588	427 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	ABCG1	P45844	678 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753		Q6ZNX1	250 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	MIER2	Q8N344	545 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	C1QL1	O75973	258 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	ARIH2	O95376	493 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RARRES1	P49788	294 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	EPHB1	P54762	984 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	DSC2	Q02487	901 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	OCA2	Q04671	838 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	MCL1	Q07820	350 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	FOXF2	Q12947	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	IL10RA	Q13651	578 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	MED15	Q96RN5	788 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	MYOC	Q99972	504 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.22	□□□□□ -1.73
HERC4-215	ENST00000515753	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753		A0A1B0GTW7	788 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SLC43A1	O75387	559 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	ANXA1	P04083	346 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	POU2F2	P09086	479 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	CKB	P12277	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	CREM	Q03060	361 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	USP45	Q70EL2	814 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	KAT5	Q92993	513 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	POLH	Q9Y253	713 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	GRM6	O15303	877 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	RFPL1	O75677	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	PRSS23	O95084	383 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	CD1A	P06126	327 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	PDC	P20941	246 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	FGFR4	P22455	802 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SLC6A2	P23975	617 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SLC6A4	P31645	630 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	CXADR	P78310	365 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	HSD11B2	P80365	405 aa		4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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