RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4Q2P0C623 313 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 LILRA4P59901 499 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 NTHL1P78549 312 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 DPP3Q9NY33 737 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 NR2E1Q9Y466 385 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF318Q5VUA4 2279 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 CLIC2O15247 247 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 C1RP00736 705 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 DPP7Q9UHL4 492 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC24AO95486 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 VNN2O95498 520 aa20.23■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2J2P51589 502 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 NUCB2P80303 420 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN21Q16825 1174 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 APPL2Q8NEU8 664 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf38Q8TB03 319 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 SENP8Q96LD8 212 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 MYADMQ96S97 322 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM209Q96SK2 561 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PIDD1Q9HB75 910 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOC1Q9NV70 894 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 COL4A3Q01955 1670 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 H7C4K7 107 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ABLIM3O94929 683 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB3P05106 788 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 CDR1P51861 262 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 USP25Q9UHP3 1055 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 POLIQ9UNA4 740 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 USTQ9Y2C2 406 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 ODC1P11926 461 aa20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP2-218ENST00000511185 HOXA9P31269 272 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF6P49848 677 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 DPYDQ12882 1025 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 BORCS6Q96GS4 357 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-218ENST00000511185 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR37L1O60883 481 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF202O95125 648 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 OAZ2O95190 189 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 TYMPP19971 482 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 ZXDAP98168 799 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 RDH13Q8NBN7 331 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-218ENST00000511185 ATF2P15336 505 aa20.19■□□□□ 0.82
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